Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clrn2B2RVW2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms