Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apol7aB2RT54 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms