Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf3B2RQG2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms