Protein–RNA interactions for Protein: B1B0V2

AU022751, Expressed sequence AU022751, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU022751B1B0V2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AU022751B1B0V2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AU022751B1B0V2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AU022751B1B0V2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
AU022751B1B0V2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AU022751B1B0V2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AU022751B1B0V2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AU022751B1B0V2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AU022751B1B0V2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
AU022751B1B0V2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AU022751B1B0V2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
AU022751B1B0V2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AU022751B1B0V2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AU022751B1B0V2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AU022751B1B0V2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
AU022751B1B0V2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
AU022751B1B0V2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
AU022751B1B0V2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AU022751B1B0V2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AU022751B1B0V2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
AU022751B1B0V2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
AU022751B1B0V2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AU022751B1B0V2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AU022751B1B0V2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
AU022751B1B0V2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AU022751B1B0V2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AU022751B1B0V2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AU022751B1B0V2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AU022751B1B0V2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AU022751B1B0V2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AU022751B1B0V2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
AU022751B1B0V2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
AU022751B1B0V2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
AU022751B1B0V2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
AU022751B1B0V2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
AU022751B1B0V2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
AU022751B1B0V2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AU022751B1B0V2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AU022751B1B0V2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
AU022751B1B0V2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
AU022751B1B0V2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
AU022751B1B0V2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AU022751B1B0V2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AU022751B1B0V2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AU022751B1B0V2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
AU022751B1B0V2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AU022751B1B0V2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AU022751B1B0V2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AU022751B1B0V2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AU022751B1B0V2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
AU022751B1B0V2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AU022751B1B0V2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AU022751B1B0V2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AU022751B1B0V2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AU022751B1B0V2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AU022751B1B0V2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AU022751B1B0V2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AU022751B1B0V2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
AU022751B1B0V2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
AU022751B1B0V2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AU022751B1B0V2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
AU022751B1B0V2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AU022751B1B0V2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AU022751B1B0V2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
AU022751B1B0V2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
AU022751B1B0V2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AU022751B1B0V2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AU022751B1B0V2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AU022751B1B0V2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
AU022751B1B0V2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
AU022751B1B0V2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
AU022751B1B0V2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
AU022751B1B0V2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms