Protein–RNA interactions for Protein: B1AW18

4930402K13Rik, MCG54973, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402K13RikB1AW18 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930402K13RikB1AW18 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930402K13RikB1AW18 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
4930402K13RikB1AW18 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
4930402K13RikB1AW18 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930402K13RikB1AW18 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930402K13RikB1AW18 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930402K13RikB1AW18 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930402K13RikB1AW18 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930402K13RikB1AW18 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930402K13RikB1AW18 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930402K13RikB1AW18 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930402K13RikB1AW18 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930402K13RikB1AW18 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930402K13RikB1AW18 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930402K13RikB1AW18 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930402K13RikB1AW18 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930402K13RikB1AW18 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930402K13RikB1AW18 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930402K13RikB1AW18 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930402K13RikB1AW18 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
4930402K13RikB1AW18 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930402K13RikB1AW18 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930402K13RikB1AW18 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930402K13RikB1AW18 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930402K13RikB1AW18 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930402K13RikB1AW18 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930402K13RikB1AW18 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
4930402K13RikB1AW18 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930402K13RikB1AW18 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930402K13RikB1AW18 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930402K13RikB1AW18 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930402K13RikB1AW18 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930402K13RikB1AW18 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930402K13RikB1AW18 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
4930402K13RikB1AW18 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930402K13RikB1AW18 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms