Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhox1B1APN4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhox1B1APN4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhox1B1APN4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhox1B1APN4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhox1B1APN4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhox1B1APN4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhox1B1APN4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhox1B1APN4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhox1B1APN4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhox1B1APN4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhox1B1APN4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhox1B1APN4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhox1B1APN4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhox1B1APN4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhox1B1APN4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhox1B1APN4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhox1B1APN4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rhox1B1APN4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rhox1B1APN4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rhox1B1APN4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rhox1B1APN4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rhox1B1APN4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rhox1B1APN4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rhox1B1APN4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rhox1B1APN4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhox1B1APN4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhox1B1APN4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhox1B1APN4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhox1B1APN4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhox1B1APN4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhox1B1APN4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhox1B1APN4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhox1B1APN4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rhox1B1APN4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms