Protein–RNA interactions for Protein: A7UAK5

Pfkfb3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2, 6-biphosphatase 3 splice variant 2, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfkfb3A7UAK5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pfkfb3A7UAK5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pfkfb3A7UAK5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pfkfb3A7UAK5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pfkfb3A7UAK5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pfkfb3A7UAK5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pfkfb3A7UAK5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms