Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF0

Skint3, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint3A7TZF0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms