Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al1jA2BFR3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms