Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhl41A2AUC9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 176.8 ms