Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FocadA2AKG8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FocadA2AKG8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FocadA2AKG8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FocadA2AKG8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FocadA2AKG8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FocadA2AKG8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FocadA2AKG8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FocadA2AKG8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FocadA2AKG8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FocadA2AKG8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FocadA2AKG8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FocadA2AKG8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FocadA2AKG8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FocadA2AKG8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FocadA2AKG8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FocadA2AKG8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FocadA2AKG8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FocadA2AKG8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FocadA2AKG8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FocadA2AKG8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FocadA2AKG8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms