Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc163A2AGD7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms