Protein–RNA interactions for Protein: A2A9G7

Shisal2a, Protein shisa-like-2A, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2aA2A9G7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisal2aA2A9G7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.4 ms