Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fam71e1A1L3C1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms