Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H2

Trbv13-3, T cell receptor beta, variable 13-3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms