Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Pcdh15-229ENSMUST00000155701 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Ggcx-201ENSMUST00000065906 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Atg9a-201ENSMUST00000040689 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Sftpa1-202ENSMUST00000170719 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Timm9-208ENSMUST00000221797 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gsdmc3-203ENSMUST00000190682 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Pmel-201ENSMUST00000054125 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Ptpn7-202ENSMUST00000167080 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Tmem56-207ENSMUST00000155309 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 9130221F21Rik-201ENSMUST00000206867 2631 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Tnfaip1-201ENSMUST00000017759 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Ep400-210ENSMUST00000146458 3673 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Tal2-201ENSMUST00000030124 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Mthfd1-201ENSMUST00000021443 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Sdhc-202ENSMUST00000111336 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Ido2-201ENSMUST00000121992 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Lsm6-203ENSMUST00000130325 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Man1b1-201ENSMUST00000042390 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Zfp111-201ENSMUST00000056683 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Ispd-206ENSMUST00000223068 2808 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Fam83c-201ENSMUST00000029143 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms