Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

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Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Scmh1-202ENSMUST00000064991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Rxfp2-202ENSMUST00000110496 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Zfp74-204ENSMUST00000108212 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Usp19Q3UJD6 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Usp19Q3UJD6 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Usp19Q3UJD6 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Usp19Q3UJD6 Gm7583-201ENSMUST00000182941 1005 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Usp19Q3UJD6 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Usp19Q3UJD6 Creb3l4-202ENSMUST00000107369 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Usp19Q3UJD6 Prr13-205ENSMUST00000171245 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Usp19Q3UJD6 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Usp19Q3UJD6 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Usp19Q3UJD6 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Gm3712-201ENSMUST00000118523 2071 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Sun1-201ENSMUST00000058716 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Tpm3-204ENSMUST00000119570 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Efna1-201ENSMUST00000029566 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Acvr1-203ENSMUST00000112599 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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