Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Slc27a6-201ENSMUST00000025500 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Zic3-201ENSMUST00000088627 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Deptor-202ENSMUST00000096433 8547 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Myo6-202ENSMUST00000076140 7663 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Nalcn-201ENSMUST00000000201 7122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa1P11477 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Actn1-202ENSMUST00000167327 2664 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Slc7a14-202ENSMUST00000108245 3080 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Itpr1-201ENSMUST00000032192 9870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Gm15953-201ENSMUST00000117656 1732 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 F5-201ENSMUST00000086040 7430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Ilf3-204ENSMUST00000213603 3430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Sgk2-202ENSMUST00000117123 3034 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Sdk2-201ENSMUST00000041627 11287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Iqgap3-204ENSMUST00000194440 3263 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Olfr169-203ENSMUST00000215476 2476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Tle3-217ENSMUST00000162973 4114 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 D430042O09Rik-201ENSMUST00000069660 6148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Cdh23-201ENSMUST00000073242 10688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Snrnp200-201ENSMUST00000103220 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Dram2-202ENSMUST00000067630 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Dyrk1a-203ENSMUST00000122284 2356 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Slco5a1-204ENSMUST00000136197 5123 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Inpp4a-205ENSMUST00000132401 3234 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 F730016J06Rik-203ENSMUST00000156508 2593 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Parp10-201ENSMUST00000075689 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Lpin1-201ENSMUST00000067124 5581 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Defa1P11477 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Dclre1b-201ENSMUST00000029435 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Atxn7l1-212ENSMUST00000146040 2973 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Tm4sf1-201ENSMUST00000029376 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Defa1P11477 1110002E22Rik-201ENSMUST00000163080 9741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Evc-203ENSMUST00000114154 3695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Gm43481-201ENSMUST00000201715 3672 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Vps33a-201ENSMUST00000031388 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Defa1P11477 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms