Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Lypd4-201ENSMUST00000079306 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm43165-201ENSMUST00000200842 1635 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm13361-201ENSMUST00000119977 1431 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Ndufa9-203ENSMUST00000205002 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm28578-203ENSMUST00000189196 1470 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Blnk-202ENSMUST00000117695 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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Col5a3Q9JLI2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Rgs8-205ENSMUST00000111815 765 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Katnal2-203ENSMUST00000123650 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Col5a3Q9JLI2 AC165249.1-203ENSMUST00000219976 392 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 AC192333.3-201ENSMUST00000224041 463 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 AC133598.3-207ENSMUST00000225918 704 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Figla-201ENSMUST00000032070 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 1700063H04Rik-201ENSMUST00000043553 817 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Col5a3Q9JLI2 Olfr1330-201ENSMUST00000094830 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Babam2-201ENSMUST00000063813 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm42974-201ENSMUST00000199556 2654 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Sdcbp-204ENSMUST00000108374 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Il18bp-203ENSMUST00000209844 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm12481-201ENSMUST00000102482 297 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Trex1-202ENSMUST00000112053 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm9095-201ENSMUST00000117607 881 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
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Col5a3Q9JLI2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Col5a3Q9JLI2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 2810455O05Rik-201ENSMUST00000138442 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Depdc1b-205ENSMUST00000171178 1404 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Xrcc2-201ENSMUST00000030773 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm28800-201ENSMUST00000186230 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm14264-201ENSMUST00000147141 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Cyp2c44-201ENSMUST00000026211 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Cyp19a1-201ENSMUST00000034811 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm11307-201ENSMUST00000121088 929 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm24597-201ENSMUST00000122503 300 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm16548-201ENSMUST00000133341 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Rit1-207ENSMUST00000172252 820 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 H2-Pb-201ENSMUST00000172731 531 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Ighv6-4-201ENSMUST00000177949 297 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm9825-201ENSMUST00000178598 843 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm24466-201ENSMUST00000179978 109 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms