Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Gm17120-201ENSMUST00000164734 743 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Gzmf-201ENSMUST00000022757 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm7790-201ENSMUST00000118716 1310 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm9864-201ENSMUST00000090043 1656 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm38220-201ENSMUST00000195774 1447 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Rps18-ps1-201ENSMUST00000120838 459 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 n-R5s154-201ENSMUST00000122513 108 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm27200-201ENSMUST00000184626 657 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm44017-201ENSMUST00000203231 740 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Gimd1-205ENSMUST00000212852 1234 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm18596-201ENSMUST00000218133 843 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 AC116589.8-201ENSMUST00000220945 364 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm17541-201ENSMUST00000080062 525 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 n-R5s25-201ENSMUST00000082923 119 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm8848-201ENSMUST00000197270 1343 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 6030469F06Rik-202ENSMUST00000218473 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Ighv14-3-201ENSMUST00000103469 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm12489-201ENSMUST00000119364 148 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm13781-201ENSMUST00000124153 492 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Apela-201ENSMUST00000124790 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Rps28-205ENSMUST00000173844 382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm7672-201ENSMUST00000180915 872 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm32772-203ENSMUST00000207022 675 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Lysmd4-203ENSMUST00000207757 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 AC151971.6-201ENSMUST00000216193 866 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 4930547H16Rik-201ENSMUST00000222281 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 CAAA01139602.1-201ENSMUST00000222545 283 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 AC123533.3-201ENSMUST00000228056 454 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Sun5-201ENSMUST00000028982 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Olfr1384-201ENSMUST00000060434 1034 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Ubap2l-203ENSMUST00000090908 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms