Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gm37567-201ENSMUST00000193241 2279 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gbx1P82976 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms