Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

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Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Tatdn3-202ENSMUST00000085633 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd1P40201 2310034C09Rik-201ENSMUST00000089111 946 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Wdr95-207ENSMUST00000202902 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Nucb2-203ENSMUST00000183175 1913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Prpf39-201ENSMUST00000120580 4069 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Mtbp-201ENSMUST00000022998 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Klrc2-202ENSMUST00000112057 1149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd1P40201 H2-M5-203ENSMUST00000169189 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Gm43802-201ENSMUST00000197826 637 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Gm5905-201ENSMUST00000211731 580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Mir181c-201ENSMUST00000083549 89 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Fam13c-203ENSMUST00000173042 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Ap3m1-201ENSMUST00000022371 1770 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Gm35618-201ENSMUST00000223164 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Pm20d1-201ENSMUST00000048660 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd1P40201 1700023G09Rik-201ENSMUST00000194513 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Gm23368-201ENSMUST00000116939 96 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Gm12817-201ENSMUST00000119622 610 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Gm11224-201ENSMUST00000120465 1111 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Gm9855-201ENSMUST00000121229 1194 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd1P40201 4930528P14Rik-201ENSMUST00000152815 509 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Bud31-207ENSMUST00000162594 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Mir7115-201ENSMUST00000184275 64 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Nuf2-203ENSMUST00000192248 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Gm37955-201ENSMUST00000195098 212 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Gm23786-202ENSMUST00000200181 119 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd1P40201 4930428N03Rik-205ENSMUST00000225654 892 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd1P40201 AC115784.1-201ENSMUST00000227687 1010 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Gm23037-201ENSMUST00000083874 324 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Gm10408-201ENSMUST00000096168 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd1P40201 AC100729.1-201ENSMUST00000225458 1454 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Gm5431-201ENSMUST00000109209 1701 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Chd1P40201 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Il1r2-201ENSMUST00000027243 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Hmox2-203ENSMUST00000120232 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Gm12751-201ENSMUST00000122336 381 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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Chd1P40201 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Calr3-202ENSMUST00000109974 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Sf3a3-201ENSMUST00000030734 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd1P40201 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Myl7-201ENSMUST00000102921 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Gm13397-201ENSMUST00000119562 878 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Vmn1r-ps103-201ENSMUST00000120171 893 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd1P40201 2310026L22Rik-201ENSMUST00000146658 400 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd1P40201 4930479D17Rik-201ENSMUST00000146754 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd1P40201 BC049715-202ENSMUST00000163640 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Lsm5-201ENSMUST00000170382 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Rpl6l-201ENSMUST00000171120 871 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Gm26445-201ENSMUST00000177557 109 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Gm34106-201ENSMUST00000193782 503 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Gm29794-201ENSMUST00000218919 1247 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Gm46391-201ENSMUST00000220704 203 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Olfr304-201ENSMUST00000077210 1002 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Gm11567-201ENSMUST00000078442 1043 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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