Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Champ1-201ENSMUST00000051870 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Pcdhgc5-201ENSMUST00000055935 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Nkx2-2os-201ENSMUST00000136998 4345 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Pdpr-201ENSMUST00000039333 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
P18530 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
P18530 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
P18530 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
P18530 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
P18530 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
P18530 Snhg11-201ENSMUST00000109488 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
P18530 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
P18530 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
P18530 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
P18530 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
P18530 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
P18530 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
P18530 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
P18530 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
P18530 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
P18530 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
P18530 Pogk-206ENSMUST00000169324 7034 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
P18530 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
P18530 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
P18530 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
P18530 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
P18530 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
P18530 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
P18530 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
P18530 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
P18530 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
P18530 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
P18530 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
P18530 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
P18530 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
P18530 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms