Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Ggct-202ENSMUST00000131475 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 5730419F03Rik-201ENSMUST00000190504 2092 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 4932430I15Rik-201ENSMUST00000180431 3306 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
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Ccl20O89093 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
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Ccl20O89093 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
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Ccl20O89093 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
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Ccl20O89093 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
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Ccl20O89093 Timm9-208ENSMUST00000221797 2564 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
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Ccl20O89093 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
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Ccl20O89093 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
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Ccl20O89093 Ik-201ENSMUST00000007042 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
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Ccl20O89093 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
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Ccl20O89093 Ep400-210ENSMUST00000146458 3673 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
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Ccl20O89093 Tpm3-204ENSMUST00000119570 2233 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Ctsa-202ENSMUST00000103092 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Ccdc87-201ENSMUST00000088653 3163 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
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