Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CrxO54751 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CrxO54751 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CrxO54751 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CrxO54751 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CrxO54751 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CrxO54751 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CrxO54751 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CrxO54751 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CrxO54751 Zmym3-203ENSMUST00000117901 5178 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
CrxO54751 Lsamp-202ENSMUST00000099761 8794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
CrxO54751 Cpne5-201ENSMUST00000024805 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
CrxO54751 Mid1-204ENSMUST00000112104 3860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
CrxO54751 Gatad2b-205ENSMUST00000199754 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
CrxO54751 Rfx2-201ENSMUST00000002444 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
CrxO54751 Gm12059-201ENSMUST00000128996 3105 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
CrxO54751 Adgrf4-201ENSMUST00000024711 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
CrxO54751 Pogz-204ENSMUST00000107269 5966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
CrxO54751 Pvt1-203ENSMUST00000181657 2798 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
CrxO54751 Gm37843-201ENSMUST00000195213 2639 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
CrxO54751 Osbpl9-218ENSMUST00000162787 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Hecw2-203ENSMUST00000120904 11263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Scfd2-208ENSMUST00000151474 3834 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Ces1c-201ENSMUST00000034189 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Klk13-201ENSMUST00000066834 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Ccdc40-202ENSMUST00000053440 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Stxbp5l-203ENSMUST00000114780 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Tbx22-202ENSMUST00000118986 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Ddo-201ENSMUST00000019977 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Olfr1395-203ENSMUST00000214195 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 AC138284.4-201ENSMUST00000216704 2882 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Gm37459-201ENSMUST00000192259 2840 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Gm35725-201ENSMUST00000221862 2800 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Trib2-201ENSMUST00000020922 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Gm43366-201ENSMUST00000199829 2655 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Srgap1-202ENSMUST00000081688 7787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 1700063K16Rik-202ENSMUST00000191341 952 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Luzp1-203ENSMUST00000105849 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Slc25a45-201ENSMUST00000025732 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Irf2-201ENSMUST00000034041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 BC030343-201ENSMUST00000199606 2439 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Zfp58-201ENSMUST00000076123 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Tmem63c-203ENSMUST00000146292 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 BC017643-202ENSMUST00000106115 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 4933416O17Rik-201ENSMUST00000220972 2122 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Gm5114-201ENSMUST00000108017 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Lsm6-203ENSMUST00000130325 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Atcay-201ENSMUST00000047408 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Unc45b-205ENSMUST00000164945 3555 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Dus4l-201ENSMUST00000020977 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CrxO54751 Dag1-202ENSMUST00000166905 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CrxO54751 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CrxO54751 Cpsf3-201ENSMUST00000067284 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CrxO54751 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CrxO54751 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CrxO54751 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CrxO54751 Prpf31-206ENSMUST00000179769 3125 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CrxO54751 Dcx-202ENSMUST00000087313 3120 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CrxO54751 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CrxO54751 Dnah9-201ENSMUST00000080665 13798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CrxO54751 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CrxO54751 Gm9979-201ENSMUST00000069457 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CrxO54751 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CrxO54751 Gm37464-201ENSMUST00000192431 2220 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CrxO54751 Cdadc1-202ENSMUST00000056997 2202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CrxO54751 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CrxO54751 Gpr85-202ENSMUST00000115491 2165 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CrxO54751 Gm35048-201ENSMUST00000192105 2802 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CrxO54751 Zfp264-202ENSMUST00000208781 2801 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CrxO54751 Cir1-201ENSMUST00000058615 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CrxO54751 Gmeb2-201ENSMUST00000049032 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms