Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL4

Pdzk1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1Q9JIL4 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pdzk1Q9JIL4 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms