Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 AC132384.10-201ENSMUST00000217862 1204 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 AC122539.3-201ENSMUST00000218355 1431 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Xpo7-201ENSMUST00000022696 4472 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Sap30bpos-201ENSMUST00000132264 2352 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Wwtr1-202ENSMUST00000120977 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm45210-201ENSMUST00000206401 1577 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Ablim1-212ENSMUST00000111558 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 AC121574.1-201ENSMUST00000228770 3132 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Trim39Q9ESN2 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Trim39Q9ESN2 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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Trim39Q9ESN2 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Ap2b1-201ENSMUST00000018875 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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