Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC88

Vwa8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa8Q8CC88 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm17644-201ENSMUST00000181272 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 CT009713.3-201ENSMUST00000224987 1565 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Tomm5-203ENSMUST00000107809 738 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm17514-201ENSMUST00000181863 1102 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Ptma-202ENSMUST00000186255 768 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Rps27-202ENSMUST00000195998 458 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Pcbd1-202ENSMUST00000218005 361 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 AC156274.1-201ENSMUST00000219193 634 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Nmb-201ENSMUST00000026817 705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm9869-201ENSMUST00000063858 375 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Proca1-202ENSMUST00000078099 1254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm26205-201ENSMUST00000082907 134 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 H2-M10.4-201ENSMUST00000057502 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 AC147366.2-201ENSMUST00000226859 2038 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Car13-201ENSMUST00000029071 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Spaca3-201ENSMUST00000103222 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Capns1-202ENSMUST00000108196 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm8809-201ENSMUST00000119367 743 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm12254-201ENSMUST00000134617 471 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm19668-201ENSMUST00000178581 747 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm37020-201ENSMUST00000195303 992 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm42375-201ENSMUST00000206226 745 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm2696-201ENSMUST00000220062 723 ntAPPRIS P5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 3830406C13Rik-213ENSMUST00000225294 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm23458-201ENSMUST00000083257 169 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Iqcf5-201ENSMUST00000085113 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm15599-201ENSMUST00000122283 1345 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm45110-201ENSMUST00000205704 1402 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Ttll7-203ENSMUST00000106134 2664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Pcgf5-202ENSMUST00000071267 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Papss1-206ENSMUST00000200527 2811 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 P2rx7-201ENSMUST00000031425 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 5830473C10Rik-202ENSMUST00000200765 1691 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Cyp2d9-201ENSMUST00000089129 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm5910-201ENSMUST00000211819 1746 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Mtcp1-202ENSMUST00000114081 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Fgf1-203ENSMUST00000117566 418 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Nsa2-ps2-201ENSMUST00000120785 773 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Rsl24d1-203ENSMUST00000165177 597 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm9117-201ENSMUST00000177735 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Crip1-205ENSMUST00000199089 509 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vwa8Q8CC88 Gm44173-201ENSMUST00000204316 132 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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