Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm45076-201ENSMUST00000207517 1517 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Ptgr2-201ENSMUST00000123614 3168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 AC154575.1-201ENSMUST00000227166 1474 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm16480-201ENSMUST00000120439 832 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm12637-201ENSMUST00000130501 368 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Rps18-206ENSMUST00000174609 527 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm45090-201ENSMUST00000208775 1148 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm43737-201ENSMUST00000199915 2740 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Ifitm7-202ENSMUST00000178021 1823 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Fcrl1-206ENSMUST00000194786 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Optc-204ENSMUST00000149380 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm23432-201ENSMUST00000157181 131 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm5627-201ENSMUST00000178539 931 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm26594-201ENSMUST00000180383 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm8828-201ENSMUST00000196786 1290 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm5905-201ENSMUST00000211731 580 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Tmem89-201ENSMUST00000026744 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Zfp133-ps-201ENSMUST00000119058 1802 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm11427-201ENSMUST00000117952 1696 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Vgll3-202ENSMUST00000227997 1383 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 A830018L16Rik-203ENSMUST00000137824 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm14633-201ENSMUST00000121152 470 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm24352-201ENSMUST00000158966 125 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm5501-201ENSMUST00000165917 832 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Gm8618-201ENSMUST00000097570 432 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprdQ64487 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Gm17644-201ENSMUST00000181272 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Gm15602-201ENSMUST00000116162 465 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Gm13303-201ENSMUST00000117125 1284 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms