Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Actb-207ENSMUST00000167721 1242 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm29487-201ENSMUST00000190146 256 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm40153-201ENSMUST00000197904 637 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 9230114K14Rik-202ENSMUST00000198720 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 AC156633.1-201ENSMUST00000215971 614 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm19090-201ENSMUST00000218187 774 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm33016-201ENSMUST00000221224 677 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 AC166061.1-201ENSMUST00000225163 1138 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 AC123061.1-201ENSMUST00000228021 999 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Rps18-201ENSMUST00000008812 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm38048-201ENSMUST00000193778 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm45110-201ENSMUST00000205704 1402 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Rack1-201ENSMUST00000020640 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm38359-201ENSMUST00000191884 2225 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm8914-201ENSMUST00000101396 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm5071-201ENSMUST00000104922 1035 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Lyrm1-204ENSMUST00000106518 875 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm13758-201ENSMUST00000118699 743 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gemin7-205ENSMUST00000122127 652 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm16013-201ENSMUST00000152249 353 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm15831-201ENSMUST00000156195 516 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm5766-202ENSMUST00000161633 799 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Tead1-211ENSMUST00000170352 1218 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm22994-201ENSMUST00000175422 82 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm31374-201ENSMUST00000213885 619 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 AC127583.1-201ENSMUST00000224351 540 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Eif3m-201ENSMUST00000028592 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm5072-201ENSMUST00000063726 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Psmf1-202ENSMUST00000109869 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Perm1Q149B8 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms