Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 AC154575.1-201ENSMUST00000227166 1474 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Myc-207ENSMUST00000188482 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Cenpx-204ENSMUST00000106155 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 1700057H15Rik-202ENSMUST00000143859 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Gm17120-201ENSMUST00000164734 743 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Tmem229b-ps-201ENSMUST00000168554 506 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Rps28-205ENSMUST00000173844 382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 AC124555.1-201ENSMUST00000227051 880 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 AC156016.4-201ENSMUST00000227470 647 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 AC140426.1-201ENSMUST00000227933 459 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Gm11437-201ENSMUST00000050771 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Olfr1115-201ENSMUST00000081986 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Zfp133-ps-201ENSMUST00000119058 1802 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 4930455D15Rik-201ENSMUST00000181632 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Ccl6-201ENSMUST00000019071 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Sdhc-202ENSMUST00000111336 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Gm8914-201ENSMUST00000101396 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Gm5071-201ENSMUST00000104922 1035 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Gm25804-201ENSMUST00000122785 188 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Pkib-204ENSMUST00000175852 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Gm5191-201ENSMUST00000222882 1236 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Fxyd1-201ENSMUST00000039909 620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Gm5072-201ENSMUST00000063726 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Ptgr2-201ENSMUST00000123614 3168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Tmem106a-201ENSMUST00000039581 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Mtbp-201ENSMUST00000022998 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Gm6721-201ENSMUST00000218353 1445 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Cux1P53564 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cux1P53564 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cux1P53564 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cux1P53564 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cux1P53564 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cux1P53564 2700038G22Rik-201ENSMUST00000181574 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cux1P53564 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cux1P53564 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cux1P53564 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cux1P53564 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cux1P53564 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cux1P53564 Snx10-202ENSMUST00000114439 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cux1P53564 Hsd17b13-203ENSMUST00000120320 1118 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cux1P53564 Banf2os-201ENSMUST00000124061 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cux1P53564 Gm26241-201ENSMUST00000174944 101 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cux1P53564 Gm23976-201ENSMUST00000175001 101 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cux1P53564 Gm22463-201ENSMUST00000175274 101 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cux1P53564 Gm22547-201ENSMUST00000175281 101 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cux1P53564 Gm22913-201ENSMUST00000175297 101 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cux1P53564 Gm23282-201ENSMUST00000175306 101 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cux1P53564 Gm25972-201ENSMUST00000175374 101 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cux1P53564 Gm22414-201ENSMUST00000175466 101 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cux1P53564 Gm26235-201ENSMUST00000175533 101 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cux1P53564 Gm25084-201ENSMUST00000175556 101 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cux1P53564 Gm24973-201ENSMUST00000175588 101 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cux1P53564 Gm23292-201ENSMUST00000175618 101 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cux1P53564 Gm23646-201ENSMUST00000178119 101 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cux1P53564 Gm24643-201ENSMUST00000178305 101 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cux1P53564 Gm24302-201ENSMUST00000178350 101 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cux1P53564 Gm26386-201ENSMUST00000178407 101 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cux1P53564 Gm25458-201ENSMUST00000178981 101 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cux1P53564 Gm22825-201ENSMUST00000179444 101 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cux1P53564 Olfr139-203ENSMUST00000206280 1059 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cux1P53564 AC113282.4-201ENSMUST00000225273 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cux1P53564 Dbil5-201ENSMUST00000040806 581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cux1P53564 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cux1P53564 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cux1P53564 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms