Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Cfap61-202ENSMUST00000118002 3230 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Micall2-204ENSMUST00000170773 3157 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Mtfr1-204ENSMUST00000130645 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Fgfr1-213ENSMUST00000167764 2915 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Proser3-201ENSMUST00000062708 1905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Ralgapb-202ENSMUST00000109485 6709 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Zfp7-201ENSMUST00000023179 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 0610030E20Rik-201ENSMUST00000077783 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Fubp1-201ENSMUST00000106121 4525 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Kif13b-203ENSMUST00000224503 8865 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 P2ry14-202ENSMUST00000091112 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Pakap-203ENSMUST00000150412 5163 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm42460-201ENSMUST00000198863 2567 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm26797-202ENSMUST00000213132 2562 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Lrba-204ENSMUST00000194759 9379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm10634-202ENSMUST00000188891 2464 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Dcun1d4-201ENSMUST00000063882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm30132-201ENSMUST00000212816 8757 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Tmem106a-201ENSMUST00000039581 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Sppl2c-202ENSMUST00000107000 2225 ntAPPRIS P4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Ctnnd1-202ENSMUST00000066177 5044 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Tyw3-204ENSMUST00000170461 4270 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Thrb-202ENSMUST00000022304 6200 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Amt-201ENSMUST00000035230 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Hcfc1-202ENSMUST00000114372 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Slc25a27-201ENSMUST00000024705 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Mthfr-202ENSMUST00000097788 2652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Prkag2-201ENSMUST00000030784 3331 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Ctc1-211ENSMUST00000161455 3989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Phc1-215ENSMUST00000161739 3893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Rcan2-201ENSMUST00000044792 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Arhgap21-208ENSMUST00000141298 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 D030018L15Rik-202ENSMUST00000139808 1859 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Stx16-201ENSMUST00000044638 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Ccdc138-201ENSMUST00000036576 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Dido1-206ENSMUST00000103057 4906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Vma21-201ENSMUST00000114575 4290 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 1810034E14Rik-201ENSMUST00000181403 1805 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Prdx6-202ENSMUST00000071718 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Kir3dl2-201ENSMUST00000072125 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm44699-201ENSMUST00000208229 5083 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 H2-Eb2-201ENSMUST00000050325 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Zc3hav1-203ENSMUST00000114900 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Sall4-203ENSMUST00000103074 3741 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Dis3l2-202ENSMUST00000168237 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Ilf3-208ENSMUST00000214758 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
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