Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gtf3c6Q9D8P7 Il17f-201ENSMUST00000039046 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gtf3c6Q9D8P7 Slco5a1-205ENSMUST00000146763 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gtf3c6Q9D8P7 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gtf3c6Q9D8P7 Tfdp1-203ENSMUST00000209396 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Ndst3-207ENSMUST00000172537 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gtf3c6Q9D8P7 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gtf3c6Q9D8P7 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Osbpl3-203ENSMUST00000114466 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gtf3c6Q9D8P7 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gtf3c6Q9D8P7 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gtf3c6Q9D8P7 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gtf3c6Q9D8P7 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Sele-201ENSMUST00000027874 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gtf3c6Q9D8P7 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16287-201ENSMUST00000097827 2324 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42837-201ENSMUST00000197071 2829 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Gtf3c6Q9D8P7 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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