Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Fes-201ENSMUST00000080932 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Rps6kc1-201ENSMUST00000061611 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Inpp4a-205ENSMUST00000132401 3234 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Sppl2c-202ENSMUST00000107000 2225 ntAPPRIS P4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Ralgapb-202ENSMUST00000109485 6709 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Hdac7-208ENSMUST00000121514 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Cpt1b-201ENSMUST00000109313 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Eno4-202ENSMUST00000200910 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Eno4-201ENSMUST00000054280 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm15612-201ENSMUST00000147542 3118 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Lamp2-202ENSMUST00000061755 3604 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Ilf3-213ENSMUST00000216892 3684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Zmiz2-204ENSMUST00000109786 4319 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm37608-201ENSMUST00000195696 1880 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Wdr78-201ENSMUST00000036451 3671 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Pmel-201ENSMUST00000054125 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Ascc2-201ENSMUST00000070257 2650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Atg9a-201ENSMUST00000040689 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Actn1-202ENSMUST00000167327 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Bcl2l11-201ENSMUST00000019281 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Gm29685-201ENSMUST00000219670 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms