Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 AC113282.4-201ENSMUST00000225273 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Bpifa5-201ENSMUST00000028986 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm13527-201ENSMUST00000117926 691 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm15539-201ENSMUST00000118452 566 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm12733-201ENSMUST00000119871 767 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm13413-201ENSMUST00000120953 602 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm25319-201ENSMUST00000122552 325 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm13377-201ENSMUST00000137984 683 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm44920-201ENSMUST00000206503 746 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Zkscan7-205ENSMUST00000216462 990 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 AC134439.3-201ENSMUST00000223486 851 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Dbil5-201ENSMUST00000040806 581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 A830005F24Rik-201ENSMUST00000065465 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm13361-201ENSMUST00000119977 1431 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Zfp386-201ENSMUST00000073551 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Pax5-202ENSMUST00000102932 1460 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Slc7a9-203ENSMUST00000118969 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 4933428M09Rik-201ENSMUST00000113046 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 1700092M07Rik-201ENSMUST00000163172 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Pkib-204ENSMUST00000175852 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Rab38-202ENSMUST00000208478 579 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm39481-201ENSMUST00000210379 512 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 AC107851.1-201ENSMUST00000215982 417 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 AC156016.4-201ENSMUST00000227470 647 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Chrm5-201ENSMUST00000099589 1599 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Serpina5-201ENSMUST00000021495 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Wdr20rt-202ENSMUST00000221658 1570 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm14138-201ENSMUST00000122061 745 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm16365-201ENSMUST00000122987 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Katnal2-203ENSMUST00000123650 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm11947-201ENSMUST00000125275 273 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Xbp1-204ENSMUST00000149623 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm16560-201ENSMUST00000159115 404 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 D730045A05Rik-201ENSMUST00000159260 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm20616-201ENSMUST00000177262 716 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm26639-201ENSMUST00000181426 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm26679-201ENSMUST00000181685 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Apex1-201ENSMUST00000049411 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Slc51b-201ENSMUST00000065894 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Olfr1155-201ENSMUST00000099843 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Tbce-201ENSMUST00000039894 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 BC051665-201ENSMUST00000026078 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Ribc1-201ENSMUST00000026288 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Ctse-201ENSMUST00000073350 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms