Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp30Q3UN04 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms