Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps29P62274 AC117648.1-201ENSMUST00000219777 2510 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps29P62274 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps29P62274 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Bcl9-207ENSMUST00000166341 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps29P62274 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Stxbp5l-206ENSMUST00000114787 4394 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Mepe-201ENSMUST00000066207 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm28578-203ENSMUST00000189196 1470 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Ctss-201ENSMUST00000015667 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm12035-201ENSMUST00000121890 623 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Rnasek-203ENSMUST00000141880 465 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Igkv4-54-201ENSMUST00000177697 288 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Proca1-202ENSMUST00000078099 1254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms