Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtskP55097 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CtskP55097 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CtskP55097 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CtskP55097 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CtskP55097 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms