Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TtrP07309 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TtrP07309 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TtrP07309 Cd300a-202ENSMUST00000106582 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TtrP07309 Tmem184b-205ENSMUST00000228002 3315 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TtrP07309 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TtrP07309 Ctc1-201ENSMUST00000021278 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TtrP07309 Tbck-202ENSMUST00000169172 6578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TtrP07309 Acox2-204ENSMUST00000164598 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TtrP07309 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TtrP07309 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TtrP07309 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TtrP07309 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TtrP07309 Cdkl2-202ENSMUST00000086978 4066 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TtrP07309 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TtrP07309 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Esrp2-201ENSMUST00000115979 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Olfr731-203ENSMUST00000214152 5572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Pkd1l3-203ENSMUST00000212537 6576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Kpna6-202ENSMUST00000102590 5710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Mcm10-202ENSMUST00000102985 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Fadd-201ENSMUST00000033394 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Prpf8-202ENSMUST00000102510 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Ablim1-212ENSMUST00000111558 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Fam122b-201ENSMUST00000071023 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Tmem56-207ENSMUST00000155309 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Traf3-202ENSMUST00000060274 6896 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Ank3-203ENSMUST00000092431 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Htr2c-201ENSMUST00000036303 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Zfp541-201ENSMUST00000108509 4561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Cdyl-201ENSMUST00000075220 3470 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Fndc1-202ENSMUST00000097425 5845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Zfp959-201ENSMUST00000054780 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Pds5a-201ENSMUST00000031104 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm37451-201ENSMUST00000194718 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TtrP07309 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Ppfia2-201ENSMUST00000029404 5429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Zfp831-201ENSMUST00000059452 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 5830462I19Rik-201ENSMUST00000168137 3383 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Tacc2-208ENSMUST00000207549 3492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Sh3pxd2b-201ENSMUST00000038753 7413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Xdh-201ENSMUST00000024866 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Vps8-204ENSMUST00000117598 4935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms