Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm12946-201ENSMUST00000122969 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm44908-201ENSMUST00000208610 266 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScaperF8VQ70 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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