Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms