Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gpatch2-202ENSMUST00000065573 4547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 1700055D18Rik-202ENSMUST00000186030 3720 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Tacc2-208ENSMUST00000207549 3492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Tnk2-206ENSMUST00000115125 4313 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Trim39Q9ESN2 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Trim39Q9ESN2 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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Trim39Q9ESN2 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Trim39Q9ESN2 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Klhl7-202ENSMUST00000163409 2857 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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