Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 CN725425-201ENSMUST00000109284 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm45076-201ENSMUST00000207517 1517 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm23081-201ENSMUST00000157845 297 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Acvr1-203ENSMUST00000112599 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Ubl5-203ENSMUST00000160124 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm8083-201ENSMUST00000203976 475 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms