Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Mthfr-202ENSMUST00000097788 2652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Prr30-201ENSMUST00000057718 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Gm39244-201ENSMUST00000209663 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Tmem63a-201ENSMUST00000027800 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 1700030K09Rik-201ENSMUST00000064853 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Gm38005-201ENSMUST00000194845 2745 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Taf8-201ENSMUST00000067103 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Sectm1a-201ENSMUST00000026162 1692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Gm35715-201ENSMUST00000197421 2054 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc38Q8CDN8 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms