Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Dsg1bQ7TSF1 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Dsg1bQ7TSF1 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Dsg1bQ7TSF1 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Dsg1bQ7TSF1 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
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