Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Gm37567-201ENSMUST00000193241 2279 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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