Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Prss23-204ENSMUST00000207932 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm11191-201ENSMUST00000117231 610 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm5400-201ENSMUST00000118494 943 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm14323-201ENSMUST00000122418 627 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 1700001J04Rik-202ENSMUST00000154037 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm23563-201ENSMUST00000174900 251 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Ppp1r2-ps1-201ENSMUST00000178232 621 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Ppp1r2-ps6-201ENSMUST00000179333 621 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm42821-201ENSMUST00000199771 489 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm29783-201ENSMUST00000219398 369 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Ccr8-201ENSMUST00000048777 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Cnfn-201ENSMUST00000076276 524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Ces1a-201ENSMUST00000095211 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Fhl3-202ENSMUST00000106199 1139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm13975-201ENSMUST00000119253 782 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm26483-201ENSMUST00000158016 104 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm8955-201ENSMUST00000182945 1008 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm44159-201ENSMUST00000204065 442 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 AC120406.1-201ENSMUST00000220362 482 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Rpl14-ps1-201ENSMUST00000026901 653 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 1810009J06Rik-201ENSMUST00000076638 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm43585-201ENSMUST00000199375 1403 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 A830018L16Rik-203ENSMUST00000137824 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Slc31a2-202ENSMUST00000107467 868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm14834-201ENSMUST00000119416 795 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Rpl7a-ps13-201ENSMUST00000121692 563 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Ctdp1-203ENSMUST00000161003 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Ccdc18Q640L5 Sh2d1a-201ENSMUST00000005839 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Cenph-201ENSMUST00000075550 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Ccdc18Q640L5 P2rx7-201ENSMUST00000031425 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gsg1-204ENSMUST00000111911 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Hdac9-208ENSMUST00000211107 1683 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Txk-203ENSMUST00000197313 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm15033-201ENSMUST00000118188 673 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm5054-201ENSMUST00000119351 453 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm12529-201ENSMUST00000119529 268 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm15798-201ENSMUST00000120082 408 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Ccpg1os-201ENSMUST00000124565 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm12977-201ENSMUST00000133742 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm5851-201ENSMUST00000194132 1204 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Pf4-203ENSMUST00000202625 411 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 AC124400.2-201ENSMUST00000224939 253 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms