Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 A430093F15Rik-201ENSMUST00000087947 985 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Nek5-201ENSMUST00000169834 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Pcdh15-221ENSMUST00000146682 1891 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Tgm7-201ENSMUST00000110675 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Gm13498-201ENSMUST00000119159 2166 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Npnt-205ENSMUST00000117456 3383 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 5430430B14Rik-201ENSMUST00000209427 1630 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Amer3-201ENSMUST00000052670 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Eftud2-212ENSMUST00000173679 2889 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Zmat2-201ENSMUST00000001419 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Nedd1-201ENSMUST00000020163 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Tdp1-207ENSMUST00000153627 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Gm37302-201ENSMUST00000192958 2998 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Hspd1-ps3-201ENSMUST00000119713 1722 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Lnpk-201ENSMUST00000064503 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Atxn1-203ENSMUST00000180110 3901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Gm38413-202ENSMUST00000198449 2348 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 AC124426.1-201ENSMUST00000220871 2707 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Gm14326-203ENSMUST00000108932 888 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 4930517L18Rik-201ENSMUST00000191880 482 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 CT025645.2-201ENSMUST00000223278 3827 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Capn3-202ENSMUST00000028749 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Zscan21-202ENSMUST00000080732 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Pklr-202ENSMUST00000107482 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Zadh2-201ENSMUST00000060223 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Il6st-210ENSMUST00000184949 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Fbxl12-206ENSMUST00000148631 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Babam2-201ENSMUST00000063813 1410 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Zfp264-202ENSMUST00000208781 2801 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 3632454L22Rik-202ENSMUST00000153610 2872 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Gm37671-201ENSMUST00000193198 2096 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Mbnl1-203ENSMUST00000191747 4046 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Ptgr2-201ENSMUST00000123614 3168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Ep400-210ENSMUST00000146458 3673 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Thap2-201ENSMUST00000020346 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Zfp354a-201ENSMUST00000020628 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Padi1-201ENSMUST00000026378 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Pitx2P97474 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pitx2P97474 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pitx2P97474 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Pitx2P97474 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Pitx2P97474 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pitx2P97474 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pitx2P97474 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pitx2P97474 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Pitx2P97474 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Pitx2P97474 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Pitx2P97474 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Pitx2P97474 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Pitx2P97474 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Pitx2P97474 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms