Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RxraP28700 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RxraP28700 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RxraP28700 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RxraP28700 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RxraP28700 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RxraP28700 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RxraP28700 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
RxraP28700 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RxraP28700 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
RxraP28700 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RxraP28700 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RxraP28700 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
RxraP28700 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RxraP28700 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RxraP28700 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
RxraP28700 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RxraP28700 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RxraP28700 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RxraP28700 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RxraP28700 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RxraP28700 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RxraP28700 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RxraP28700 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
RxraP28700 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RxraP28700 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RxraP28700 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RxraP28700 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
RxraP28700 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RxraP28700 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
RxraP28700 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RxraP28700 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RxraP28700 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RxraP28700 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RxraP28700 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
RxraP28700 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RxraP28700 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RxraP28700 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RxraP28700 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RxraP28700 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RxraP28700 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RxraP28700 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RxraP28700 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RxraP28700 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RxraP28700 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RxraP28700 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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