Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P20040 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P20040 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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